Dès le Ve siècle avant J.-C., Platon relate l'histoire puis la disparition de l'Atlantide, île mystérieuse située en Méditerranée orientale, non loin de l'actuelle Crète. L'Atlantide aurait abrité, à l'âge du bronze, la fastueuse civilisation minoenne. Remontant le temps, le documentaire mêle deux destins : celui d'un jeune Minoen qui réussit il y a 3 500 ans à sauver de justesse une statuette, avant de périr lors de la secousse qui engloutit l'Atlantide. Et celui d'un jeune Américain qui survit au milieu des années 1950 à un fort séisme à Hawaii, et qui deviendra géologue.